O Castro de Santa Margarida encontra-se classificado como imóvel de Interesse Público (Dec. N.º 29 / 90, DR n.º 163 de 17 de julho de 1990).

O povoado encontra-se implantado num pequeno promontório da face norte do maciço montanhoso conhecido por Serra de Monte Córdova. A vertente da face norte corresponde ao prolongamento natural do maciço montanhoso que apresenta uma progressiva diminuição de cotas, a partir do ponto mais alto registado na Citânia de Sanfins, Paços de Ferreira. O seu posicionamento sobranceiro ao rio Vizela, assim como a sua cota (283 m), permite um controle visual muito significativo para norte, leste e oeste abarcando uma parte significativa do tramo inferior do rio Vizela e do tramo médio do rio Ave.
Estruturalmente apresenta uma planta oval, definida pela curva de nível dos 250 m, com o maior eixo no sentido norte/sul, exibindo uma acrópole relativamente plana, apesar da existência de abundantes afloramentos graníticos à superfície.
O substrato geológico onde se inscreve o povoado corresponde à grande mancha de granito biotítico da face oriental do concelho que apresenta variedades porfiroides e granosas de grão de diferente calibre atravessada por veios haplíticos.